Odjel za zaštitu okoliša bavi se općim i posebnim problemima u zaštiti okoliša pri
planiranju, pripremi izgradnje i izgradnji te prestanku rada energetskih, industrijskih
i komunalnih objekata. U djelokrugu rada Odjela je i tehničko-ekonomsko optimiranje te
izbor struktura, sustava i komponenata važnih za zaštitu okoliša. U suradnji s drugim
odjelima u Ekonergu te s vanjskim suradnicima – specijalistima za pojedina specifična
područja Odjel može riješiti skoro svaki problem u zaštiti okoliša u skladu s konceptom
održivog razvoja i suvremenom praksom.